中華民國66年10月13日會研字第1937號函發布
中華民國66年11月30日函修正 
中華民國67年4月26日函修正 
中華民國69年10月15日會研字第2957號函修正
中華民國76年6月10日會研字第1547號函修正
中華民國78年7月7日會研字第2349號函修正
中華民國80年9月24日會研字第5210號函修正
中華民國81年8月29日會研字第4507號函修正
中華民國81年11月18日會研字第6583號函修正
中華民國82年6月1日會研字第3067號函修正
中華民國83年8月23日會研字第2765號函修正
中華民國85年1月9日會研字第51號函修正
中華民國87年6月3日會研字第2196號函修正
中華民國88年7月12日會研字第3428號
中華民國89年12月6日會研字第23459之1號函修正
中華民國98年3月6日會研字第0982160349號函修正「行政院研究發展考核委員會專案研究作業要點」，名稱並修正為「行政院研究發展考核委員會委託研究計畫作業要點」
中華民國99年10月5日會研字第0992161909號函修正第五點附件1
中華民國103年7月7日發社字第1031301158號函停止適用